Отличий никаких - slind-проект является обычным C++ проектом(отдельного класса нет). Есть org.slind.ei.core.SlindProjectNature которая несёт тэговую функцию и при назначении проекту добавляет к нему org.slind.ei.core.SudoCallBuilder в качастве билдера. Это и ещё несколько ухишрений позволяют подменять все используемые CDT пути и комманды на чрутовые. В общем плагин в основном занимается обманом остальной среды :)