Сюда же включаю все парсеры и инструменты сериализации.
Хочется: фреймворк по типу Jena с полным представлением онтологии в виде объектов

Пока ничего не нашел

Raptor RDF Parser Library - набор парсеров и сериалайзеров, поддерживающий RDF-триплеты и словари(из известных мне - Dublin Core, OWL ). Представление - какие-то гнусные "объекты Си" - порождение извращенных фантазий какого-то фиолетового осьминога.

Утверждают, что есть отличная интеграция с Rasqal RDF Query Library(запросы к RDF) и Redland Language Bindings (API на разных языках, в т.ч. Python (смотри здесь)).

Поддержка OWL - практически отсутствует, за исключением уровня пространств имён. OWL-файлы представляются как RDF.

Синтаксис - своеобразный. Следующий код съест на входе файл формата RDF/XML и выведет на экран RDF-тройки.

#include <stdio.h>
#include <raptor.h>
 
/* rdfprint.c: print triples from parsing RDF/XML */
 
void
print_triple(void* user_data, const raptor_statement* triple) 
{
  raptor_print_statement_as_ntriples(triple, stdout);
  fputc('\n', stdout);
}
 
int
main(int argc, char *argv[])
{
  raptor_parser* rdf_parser=NULL;
  unsigned char *uri_string;
  raptor_uri *uri, *base_uri;
 
  raptor_init();
 
  rdf_parser=raptor_new_parser("rdfxml");
 
  raptor_set_statement_handler(rdf_parser, NULL, print_triple);
 
  uri_string=raptor_uri_filename_to_uri_string(argv[1]);
  uri=raptor_new_uri(uri_string);
  base_uri=raptor_uri_copy(uri);
 
  raptor_parse_file(rdf_parser, uri, base_uri);
 
  raptor_free_parser(rdf_parser);
 
  raptor_free_uri(base_uri);
  raptor_free_uri(uri);
  raptor_free_memory(uri_string);
 
  raptor_finish();
}

Если хватает RDF-а, то Redland, Rasqal и Raptor будут хорошим выбором.

Если нужно представление в виде OWL, то не подходит.

FACT++ - движок вывода OWL-DL, написанный на C++ и Java. Возможно, предоставляет API для OWL на Java. В исходниках (пакет Core) есть похожие на правду названия файлов (individuals и пр.) пока разбираюсь, можно ли использовать FACT++ как Jena.

Абсолютно нет документации, кроме комментариев в коде. Послал письмо создателю - англичанину Дмитрию Царькову .

• Бритва Эйлера - поддерживающий нотацию N3 движок вывода.

[[http://rdflib.net/]]

OWL Logic - Что-то про Python OWL API и кучу других полезных OWL-штучек. Вот тут - исходники на py