Инструкция по переводу файла nii в файл stl

Найден следующий рабочий метод:

Перевод nii в dicom nii2dcm github

pip install nii2dcm

nii2dcm nifti-file.nii.gz dicom-output-directory/ -d MR

Перевод dicom в stl dicom2mesh github

Скачать докер-файл

docker build -t dicom2mesh -f ./Dockerfile.txt .

docker run -v <директория, с файлами dicom>:/data dicom2mesh -i /data -t <значение iso (например, 557)> -o /data/mesh.stl