Найден следующий рабочий метод:
-
pip install nii2dcm
nii2dcm nifti-file.nii.gz dicom-output-directory/ -d MR
-
-
docker build -t dicom2mesh -f ./Dockerfile.txt .
docker run -v <директория, с файлами dicom>:/data dicom2mesh -i /data -t <значение iso (например, 557)> -o /data/mesh.stl