projects:otolaryngologist:medical_image_analysis_software
Differences
This shows you the differences between two versions of the page.
Both sides previous revisionPrevious revisionNext revision | Previous revision | ||
projects:otolaryngologist:medical_image_analysis_software [2023/04/23 21:57] – evinogradova | projects:otolaryngologist:medical_image_analysis_software [2023/06/03 23:12] (current) – ↷ Page name changed from projects:otolaryngologist:nasal_septum_selection_principles to projects:otolaryngologist:medical_image_analysis_software kel | ||
---|---|---|---|
Line 1: | Line 1: | ||
====== Сравнение систем анализа медицинских изображений ====== | ====== Сравнение систем анализа медицинских изображений ====== | ||
- | ^ ^ [[# | + | ^ ^ [[# |
- | |Open Source | + | |Open Source |
- | |Языки программирования | + | |Языки программирования |
- | |Технологии интерфейса пользователя | + | |Технологии интерфейса пользователя |
- | |Механизм реализации расшиений/ | + | |Механизм реализации расшиений/ |
- | |Система сборки | + | |Система сборки |
- | |Дата последней версии | + | |Дата последней версии |
+ | ====== Сравнение основных свойств исследуемых приложений ====== | ||
+ | ^ ^ [[# | ||
+ | |Пользовательский интерфейс | 6/10 | 7/10 | 8/10 | | ||
+ | |Функциональность | 9/10 | 8/10 | 6/10 | | ||
+ | |Пригодность к расширению функционала | ||
+ | |Наличие документации и иной информации | ||
+ | |Производительность | ||
+ | |Качество 3D моделирования | ||
===== 3D Slicer ===== | ===== 3D Slicer ===== | ||
> // | > // | ||
Line 13: | Line 21: | ||
Особенности: | Особенности: | ||
- | * Интеграция с Jupyter notebook | + | * Интеграция с Jupyter notebook; |
- | Сегментация изображения (или контурирование) – это | + | * В приложении рабочая область с достаточно большим функционалом; |
- | процедура | + | * Oбласть в которой будут отображаться снимки |
- | соответствующих различным | + | * Подход |
- | процедура необходима для визуализации | + | * Возможность оперативно и без особых усилий подгрузить файлы КТ-снимков; |
- | параметров, ограничения области анализа и т. д.\\ | + | * Высокое качество 3D моделей; |
- | Сегментация может быть произведена | + | * Большое количество документации, а так |
- | используются | + | ===== InVesalius 3 ===== |
- | сегментации. 3D Slicer | + | > // |
- | реализованы различные методы сегментации.\\ | + | |
- | Полученные | + | |
- | представлены в различном виде. Некоторые способы | + | |
- | представления, их достоинства и недостатки представлены на рис. | + | |
- | 1. | + | |
+ | Особенности: | ||
+ | * Более современный интерфейс; | ||
+ | * Поддержка русского языка; | ||
+ | * Позволяет без особых усилий подгрузить файлы; | ||
+ | * Высокое качество 3D моделей. | ||
+ | ===== Starviewer ===== | ||
+ | > // | ||
+ | |||
+ | Особенности: | ||
+ | * Функционал приложения открывается в нужный момент; | ||
+ | * Приятное оформление; | ||
+ | * Хорошая производительность. | ||
+ | ===== Вывод ===== | ||
+ | Исходя из большего функционала, | ||
+ | отдается разработке на основе 3D Slicer. | ||
+ | ====== Средства идентификации носовой перегородки ====== | ||
+ | Сегментация изображения (или контурирование) – это процедура очерчивания участков изображения, | ||
+ | |||
+ | Сегментация может быть произведена вручную, | ||
+ | |||
+ | Полученные в результате сегментации участки могут быть представлены в различном виде. Некоторые способы представления, | ||
+ | {{ рис.1.jpg? | ||
+ | |||
+ | Чаще всего используется представление в виде binary | ||
+ | labelmap, так как данные в таком представлении проще | ||
+ | редактировать.3D Slicer предоставляет модули для работы с сегментацией, | ||
+ | такие как Segment editor и Segment statistics.\\ | ||
+ | |||
+ | Модуль Segment editor позволяет выделять сегменты на | ||
+ | 2D/3D/4D изображениях. Данный модуль предлагает инструменты | ||
+ | для редактирования перекрывающих друг друга сегментов, | ||
+ | редактирования данных, | ||
+ | {{ рис.2.jpg? | ||
+ | |||
+ | Модуль Segment statistics позволяет считать позволяет | ||
+ | считать статистику для выбранной структуры. Расчеты параметров | ||
+ | производятся на структуре, | ||
+ | — это стоит иметь в виду, так как точность такого вида | ||
+ | представления ограничена.\\ | ||
+ | Ниже представлены основные параметры, | ||
+ | модулем, | ||
+ | поставленной задачи: | ||
+ | - Объём сегмента (в мм2 и см2). Метаданные формата DICOM содержат информацию о размере пикселей, | ||
+ | - Площадь поверхности (в мм2); | ||
+ | - “Округлость” сегмента; | ||
+ | - Плоскостность сегмента; | ||
+ | - Вытянутость сегмента (elongation). | ||
+ | Краткое описание функционала Segment statistics представлено в | ||
+ | [[https:// | ||
+ | параметров и код для их расчёта можно найти [[https:// |
projects/otolaryngologist/medical_image_analysis_software.1682276268.txt.gz · Last modified: 2023/04/23 21:57 by evinogradova