Для начала следует вычекнуть проект из CVS Есть два варианта: средствами Eclipse или средствами операционной системы

• Выбираем меню File→ Import
• В открывшемся окне из всех возможных вариантов выбираем CVS/ Projects from CVS, нажимаем NEXT
• Указываем параметры доступа к cvs
• Указываем что выкачивать: projects/metamind/ (палка после metamind - обязательна)

• Настроить cvs
• Выполнить команду cvs co projects/metamind ¹⁾
• После этого импортировать проект в Eclipse
  • Выбираем меню File→ Import
  • В открывшемся окне из всех возможных вариантов выбираем General / Existing Projects into Workspace и нажимаем Next
  • Задаем директорию с проектом (например ~/workspace/projects/metamind) и нажимаем Finish
  • Проект экспортирован

Теперь подключаем нужные jar-файлы.

В свойствах проекта (Правой кнопочкой на названии проекта выбрать меню Build Path/Configure Build Path) можно увидеть, что требуется что все jar-файлы находились в папке jars. В cvs такой директории нет, поэтому мы создаем ее локально и складываем туда все jar файлы из архива Jena + из архива с JGraph/lib файл jgraph.jar. Итого у нас в директории jars должны присутствовать следующие файлы:

• antlr-2.7.5.jar
• arq-extra.jar
• arq.jar
• commons-logging-1.1.1.jar
• concurrent.jar
• icu4j_3_4.jar
• iri.jar
• jena.jar
• jenatest.jar
• jgraph.jar
• json.jar
• junit.jar
• log4j-1.2.12.jar
• lucene-core-2.3.1.jar
• stax-api-1.0.jar
• wstx-asl-3.0.0.jar
• xercesImpl.jar
• xml-apis.jar

Чтобы эти файлы стали доступны добавляем директорию jars к проекту

• Правой кнопкой на названии проекта, выбираем New/Folder
• В качестве имени директории (Folder name) указываем jars
• Раскрываем по кнопочке Advanced доп. свойства и указываем путь к созданной директории jars
• Нажимаем Finish для добавление директории jars в проект

В свойствах проекта указан путь к jdk. Если в Build Path (Правой кнопочкой на названии проекта выбрать меню Build Path/Configure Build Path) показан красный крест на JRE System Library, но по указанному пути он не нашел ничего и следует указать пусть к другому JRE. Eсли он не установлен, нужно скачать JRE от SUN ²⁾

• Установка из rpm (скачать файл jdk-6u7-linux-i586-rpm.bin)
  • Установка производится из-под пользователя root в каталог /usr/java/jdk1.6.0_07
• Установка из бинарного файла ( jdk-6u7-linux-i586.bin)
  • Установка производится из-под любого пользователя в каталог с бинарным фалом

• Правой кнопочкой на названии проекта выбрать меню Build Path/Configure Build Path
• Из списка выбрать JRE System Library и нажать Edit…
• В открывшемся окне выбрать Alternate JRE и нажать Installed JREs…
• Добавить в список используемых JRE только что установленное, нажав Add и указав путь к JDK (/usr/java/jdk1.6.0_07) (кнопка Browse)
• Нажать ОК.
• В окне доступных JRE снять все установленные флажки, кроме jdk1.6.0_07. Нажать ОК.
• Установить к качестве используемой библиотеки - библиотеку по-умолчанию (а именно jdk1.6.0_07) выбрав “Workspace default JRE” и нажать Finish
• Пути ко всем файлам указаны, о чем можно судить по отсутствию красных крестиков в таблице Libraries Build Path проекта.

После этого в проекте должны разрешиться все зависимости и он скорее всего соберется.