Калишенко. Е.Л., Соколов И.С., Рудакова А.А., Шафиев А.Р.
«Использование многоядерных и кластерных архитектур для повышения скорости решения задач траекторной обработки».
Известия СПбГЭТУ «ЛЭТИ», выпуск 2/2007

Калишенко Е.Л., Кринкин К.В.
«Система топологического моделирования структуры белковых молекул».
Прикладная информатика, выпуск 4(22) 2009

Калишенко Е.Л., Королёв Ю.А., Крестелёв Д.В., Филиппов М.Ф.
«Автоматизированная система сборки и тестирования проектов для различных программно-аппаратных платформ».
Известия СПбГЭТУ “ЛЭТИ”, выпуск 10/2010

Калишенко Е.Л., Кринкин К.В.
«Подходы к прогнозированию трафика в беспроводных Mesh-сетях».
Прикладная информатика, выпуск 6(30) 2010

K.Krinkin, E.Kalishenko, S.P.Shiva Prakash
“Process Mining Approach for Traffic Analysis in Wireless Mesh Networks”
Internet of Things, Smart Spaces and Next Generation Networking. Lecture Notes in Computer Science, 2012, Volume 7469/2012, 260-269

Е.Л.Калишенко, Ю.В. Романенко.
«Технологические аспекты реализации компьютерных обучающих систем с трехмерной графикой в среде QNX».
Известия СПбГЭТУ «ЛЭТИ», Вып. 9/2013

Галимуллин М. Ф., Калишенко Е. Л., Рапоткин Н. А.
Анализ производительности стратегий синхронизации потоков в структурах данных, основанных на flat-combining.
Известия СПбГЭТУ «ЛЭТИ», Вып. 7/2016

Кирдяшкин Б.М., Калишенко Е. Л.
Разработка неблокирующих конкурентных структур данных на основе временных меток
Известия СПбГЭТУ «ЛЭТИ», Вып. 6/2017

Калишенко Е.Л., Балтрашевич В.Э.
«Система моделирования структуры белковых молекул. Модуль визуализации результатов».
Материалы межвузовского конкурса-конференции студентов, аспирантов и молодых учёных Северо-Запада, Санкт-Петербург Издательство Политехнического университета, 2010

Калишенко Е.Л., Кринкин К.В., Балтрашевич В.Э.
«Методы адаптивной формализации экспертных знаний для систем интеллектуального анализа данных».
Научная сессия МИФИ - 2010. Сборник научных трудов. - 2010. - Т.367-67

Kirill Krinkin, Eugene Kalishenko
«Traffic prediction in Wireless Mesh Networks using Process Mining algorithms».
Proceedings of 11th Conference of Open Innovations Association FRUCT, St-Petersburg, April 2012

Lesnova O., Kalishenko E.
“NS-3 Performance Analysis and Development of Effective Load Balancing Algorithms”
Proceedings of 13th Conference of Open Innovations Association FRUCT, Petrozavodsk, April 2013

Marsel Galimullin, Eugeny Kalishenko, Nikolay Rapotkin
Performance analysis of thread synchronization strategies in concurrent data structures based on flat-combining
Proceedings of 18th Conference of Open Innovations Association FRUCT, Saint-Petersburg, April 2016